乌鲁木齐市中医医院建于 1960 年，是集中医医疗、教学、科研工作为一体的综合性中医医院。医院临床科室建制齐全。
设两部（院）和两个门诊，一部（红山医院），二部（南门医院）。小十字保元门诊位于繁华的商业中心；南站门诊位于客流较大的南客站，地理位置的相对优势为医院的服务网络奠定了基础。
乌鲁木齐市中医院现有职员 630 人，专业技术人员占 85% ，副主任医师以上专家 55 人，开放一床位 400 张，年门诊量 33 万人次，年住院人数 6500 人。医院拥有 CR 、 CT 、腹腔镜、全自动生化分析仪、彩色多普勒、肿瘤微波治疗等先进检查设备。拥有全市最完备的制剂中心和辅助治疗室；到位的配套后勤保障服务系统，管理制度建全。
乌鲁木齐市中医院持“以病人为中心，以质量为核心”，“以提高疗效为重点，以两个效益为目标”的办院方针，加大改革力度，更新观念，重视引进、培养人才，狠抓服务质量，始终把“扬中医之长、纳西医之优、仁智存心中，诚信求发展”的服务理念贯穿于医疗服务的全过程，赢得了患者的赞誉。
乌鲁木齐市中医院的重点专科为糖尿病专科、心脑血管病专科、肛肠病专科、前列腺专科，同时开展了中医药对老年性疾病、精神病疾病、亚健康状态、养生康复的临床研究和治疗。
乌鲁木齐市中医院 1996 年被评为“国家三级乙等中医医院”、 1995 年被乌鲁木齐市人民政府授予“科教兴市先进集体”、 2000 年被授权为“新疆医科大学教学医院”、 2000 年被确定为自治区、兵团、乌鲁木齐市城镇职工基本医疗保险定点医院、 2003 年被中央乌市委员会、乌市人民政府、乌市警备区共同授予爱国拥民模范单位称号， 2004 年被评为自治区级文明单位， 2003 年、 2004 年连续两年被评为乌鲁木齐市卫生系统综合目标考核个性单位。